El IRD está presente en el Mediterráneo desde 1957 y actualmente cuenta con 3 représentantes.
Esta región, poseedora de varias ventajas (población joven e instruida, pobreza absoluta poco extendida y recursos naturales disponibles) se confronta con las presiones sociales y ecológicas cada vez más importantes, que interrogan las modalidades de su desarrollo a mediano y largo plazo.
Los trabajos del IRD en el Mediterráneo tratan principalmente de los recursos de agua, los ecosistemas terrestres y litorales, las condiciones de vida y de movilidad de las poblaciones, las cuestiones de gobernanza, los riesgos naturales.